MITSS與製造企業的資訊化唇齒相依，製造企業的資訊化為服務業發展提供了市場、機遇，但技術服務也直接影響著企業資訊化的效果，因此，必須腳踏實地地積極推進、逐步規範。但近年來，由於多種原因，製造業資訊化業界浮躁、炒概念之風較盛，泡沫不少，必須要清醒地認識到以下幾個問題：
1.資訊化不能代替工業化，資訊化是協助改進製造的問題
以資訊化帶動工業化，其核心是用資訊技術改造傳統產業，加快完成工業化，工業化的進程本身是不能夠逾越的，資訊技術不能取代製造技術。因此，製造業企業不能為了資訊化而資訊化，而是必須與企業的發展戰略與經營目標結合起來，在適當的時候選擇合適的解決方案。後發優勢下，必須要清醒地認識到資訊化僅僅是資訊化，不能誇大其辭。MITSS的建設，要在工業化與資訊化的演繹中找準自己的定位，發揮真正的作用。
2.ERP不等於資訊化，資訊化不是電腦化
很長一段時間以來，ERP市場概念滿天雲遮霧罩，用友提出ERP普及化，金蝶提出ERP個性化，新中大ERP精細化，浪潮提出ERP標準化。很多企業認為，ERP就是企業資訊化，財務軟體就是ERP。其實，無論從時間、從深度、從廣度，ERP都不可能取代資訊化，它只是現階段企業資訊化的一部分。根據Gartner的定義，ERP是MRP II(製造資源計劃)的下一代，內涵是“打破企業的四壁，把資訊集成的範圍擴大到企業的上下游，管理整個供需鏈，實現供需鏈製造。” ERP是管理整個供需鏈的資訊化管理系統，而不是專指某一個軟體。在全球化、數字化、網路化的知識經濟時代，資訊化的概念也在不斷地完善，已經涉及到管理模式、流程的變革，因此，資訊化也並不是電腦化。
3.抓大不能放小，示範效應不能僅看經濟效益
政府對推進製造業資訊化，採用抓示範、樹典型的方式，而示範最終變成了大企業獨唱、小企業旁觀。抓大企業更容易出政績，但如此一來小企業就必然受冷落。我國企業的97%是中小企業，64%的GDP來源於中小企業，它們給國民經濟帶來的活力和動力是非常大的。因此，政府要給予實在的引導性支援，不能重大輕小，不能抓大放小，評價示範效應不能僅看經濟效益。
4.加強項目評審的透明性，避免權力尋租
很多地方的仲介機構都與政府部門存在某種聯繫，仲介機構也參與項目評審，有些企業為了爭取到政府資金支援，便與仲介機構聯合申報或由仲介機構擔任項目顧問，因此，項目評審過程便出現了仲介機構權力尋租的現象。這是由於大多數科技項目的評審是不透明的，也沒有公佈評審標準和規則，規範的缺乏導致監督的缺位。這種增收模式不是商業模式，也無助於提高仲介自身的核心競爭力。因此，有必要加強項目評審的透明性，建立評價的原則、打分標準，明確評審的過程，公示評審的結果。
